Existem várias maneiras de montar uma impugnação.
Você pode simplesmente negar tudo o que está no laudo, mas somente negar não ajuda em nada.

Você tem que realmente apontar os problemas e, na sequência, apontar outro ponto de vista, é isso o que o seu cliente espera de você.

Uma das maneiras que eu mais gosto de trabalhar é abrindo os dois documentos: o laudo que eu vou impugnar, e a minha impugnação.
Assim fica mais fácil construir o raciocínio, fazendo a leitura de um lado, e já colocando do outro lado os argumentos.

Você também já pode deixar seu parecer técnico separado, para que você possa, na sequência, também colocar os argumentos técnicos que você construiu.

Uma outra estratégia é já ir construindo os quesitos complementares.
Ou seja, enquanto estou construindo a impugnação, já faço as perguntas que eu sei que o perito tem que responder, que ficaram inconsistentes no laudo que ele apresentou.